在工业污水处理中，氮肥废水主要要去除的指标为COD与氨氮，由于氮肥废水的C/N低，有机物的可生化性好，氨氮废水浓度相对比一般工业污水高，同时含有一定氰化物、硫化物等有害抑制微生物的物质，处理难度大，导致脱氮效果不是很好。

目前在工业污水处理中氮肥废水可以采用物化法与生物法进行处理。物化法有着投资少、操作简单、处理效果稳定等优点，在氨氮废水处理中有着一定的地位，但其成本较生物处理法高、容易产生二次污染物的缺点阻止了该方法普及的脚步。生物法则有通过厌氧和好氧两种处理方式进行处理，主要的除氨氮的工艺有传统的硝化反硝化法、氧化沟法、SBR法、接触氧化法等；还有新型的脱氮工艺如厌氧氨氮化法、短程硝化法、异养硝化法、好氧反硝化法等，以及以生物法为主要处理部分，与物化法结合的各种联合工艺。

在工业污水处理中的氨氮废水中不仅仅含有COD及氨氮、总氮，还有总酚等不易于生物降解物或者对生物有抑制作用的污染物，当废水进入生化处理单元时，微生物的对污染物的处理能力变差，就会致使出水的水质未达到理想的要求等不利影响。然而在工业污水处理中，工业企业会选择相对经济上占有优势的生物法，而针对总酚以及不易于生物降解与对生物抑制污染物不做检测与应对措施，致使后续生化处理效果未达到所需的标准。

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